Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

Última versión Publicado por SCAR - Microbial Antarctic Resource System en Mar 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

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Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Scientific Committee on Antarctic Research.

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¿Quién creó el recurso?:

Eric Collins
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences Fairbanks US

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Eric Collins
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences Fairbanks US

¿Quién documentó los metadatos?:

Maxime Sweetlove
Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences Rue Vautier 29 1000 Brussels BE

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Usuario

Cobertura Geográfica

Complete coverage of the Arctic marine environments.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [67.668, -176.761], Latitud Máxima Longitud Máxima [89.99, 157.828]

Cobertura Taxonómica

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Dominio  Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Dominio  Bacteria (Bacteria),  Archaea (Archaea)

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2007-11-20 / 2016-07-29