Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

Dernière version Publié par SCAR - Microbial Antarctic Resource System le Mar 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

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L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Scientific Committee on Antarctic Research.

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Metadata

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Eric Collins
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences Fairbanks US

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Eric Collins
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences Fairbanks US

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Maxime Sweetlove
Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences Rue Vautier 29 1000 Brussels BE

Autres personnes associées à la ressource:

Utilisateur

Couverture géographique

Complete coverage of the Arctic marine environments.

Enveloppe géographique Sud Ouest [67.668, -176.761], Nord Est [89.99, 157.828]

Couverture taxonomique

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Domain  Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Domain  Bacteria (Bacteria),  Archaea (Archaea)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2007-11-20 / 2016-07-29