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Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments

バージョン 1.0 SCAR - Microbial Antarctic Resource System によって公開 Jan 31, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

Microbial dataset containing sequenced genes (ureC gene) from Thaumarchaeota from the Beaufort Sea (Arctic) and the Amundsen Sea (Antarctica), as well as a metagenome (454 pyrosequencing) the Beaufort Sea.

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バージョン

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引用方法

注意してください、これは、古いバージョンのデータセットです。  研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Alonso-Saez L, Waller A, Bakker K, Farnelid H, Yager P, Lovejoy C, Tremblay J, Potvin M, Heinrich F, Estrada M, Riemann L, Bork P, Pedros-Alio C, Bertilsson S (2019): Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments. v1.0. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. http://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea&v=1.0

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は SCAR - Microbial Antarctic Resource System。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3が割り当てられています。   Scientific Committee on Antarctic Research によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSCAR - Microbial Antarctic Resource System が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Metadata

連絡先

リソースを作成した人:

Laura Alonso-Saez
Uppsala University Uppsala SE
Alion Waller
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg DE
Kevin Bakker
University of Michigan Ann Arbor US
Hanna Farnelid
Linnaeus University Kalmar SE
Patricia Yager
University of Georgia Athens US
Connie Lovejoy
Université Laval Québec CA
Jean-Eric Tremblay
Université Laval Québec CA
Marianne Potvin
Université Laval Québec CA
Frederike Heinrich
Uppsala University Uppsala SE
Marta Estrada
Institut de Ciències del Mar Barcelona ES
Lasse Riemann
University of Copenhagen Helsingør DK
Peer Bork
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg DE
Carlos Pedros-Alio
Institut de Ciències del Mar Barcelona ES
Stefan Bertilsson
Uppsala University Uppsala SE

リソースに関する質問に答えることができる人:

Laura Alonso-Saez
Uppsala University Uppsala SE

メタデータを記載した人:

Maxime Sweetlove
Research assistent
Royal Belgian Institute for Natural Sciences 1000 Brussels BE

他に、リソースに関連付けられていた人:

データ利用者

地理的範囲

Amundsen Sea (Antarctica, Southern Ocean); Beaufort Sea (Arctic)

座標（緯度経度） 南 西 [-77.02, -123.897], 北 東 [71.033, 170.5]

生物分類学的範囲

Archaea

Domain  Archaea (Archaea)

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments
ファンデイング 454 pyrosequencing was supported by the K&A Wallemberg foundation. This work is a contribution to the International Polar Year–CFL system study (2007/2008) supported through grants from the Canadian International Polar Year Federal Program Office and the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Canada, the Spanish Ministry of Science and Innovation Grant Boreal CLG2007-28872-E/ANT, and the Swedish Research Council. Additional support was given by the Marie Curiellowship PIEFGA-2008-221121 and a “Juan de la Cierva” contract from the Spanish Ministry of Science and Innovation. We acknowledge support by the National Science Foundation Antarctic Organisms and Ecosystems ProgramGrants ANT-0741409 and ANT-08361440; Swedish Research Council Environment, Agricultural Sciences, and Spatial Planning Grant 217- 2006-342; and NSERC of Canada.

プロジェクトに携わる要員:

Laura Alonso-Saez

収集方法

Samples were collected by using a ship-deployed rosette for open water sampling and through the ship’s internal moon pool for winter ice-covered sampling.

Study Extent Water samples were collected near the surface and in deeper halocline waters from the Arctic Southeast Beaufort Sea during the overwintering CFL cruise and in the upper 500 m from the Antarctic Amundsen and Ross seas during the summer in the Oden Southern Ocean cruise.

Method step description:

  1. details are given in: https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2012/09/27/1201914109.DCSupplemental/sapp.pdf

書誌情報の引用

  1. Alonso-Sáez, L., Waller, A. S., Mende, D. R., Bakker, K., Farnelid, H., Yager, P. L., ... & Estrada, M. (2012). Role for urea in nitrification by polar marine Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(44), 17989-17994.