Description
Microbial dataset containing sequenced genes (ureC gene) from Thaumarchaeota from the Beaufort Sea (Arctic) and the Amundsen Sea (Antarctica), as well as a metagenome (454 pyrosequencing) the Beaufort Sea.
Versions
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Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Alonso-Saez L, Waller A, Bakker K, Farnelid H, Yager P, Lovejoy C, Tremblay J, Potvin M, Heinrich F, Estrada M, Riemann L, Bork P, Pedros-Alio C, Bertilsson S (2019): Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments. v1.1. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea&v=1.1
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3. SCAR - Microbial Antarctic Resource System publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Scientific Committee on Antarctic Research.
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Metadata
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Couverture géographique
Amundsen Sea (Antarctica, Southern Ocean); Beaufort Sea (Arctic)
Enveloppe géographique | Sud Ouest [-77,02, -123,897], Nord Est [71,033, 170,5] |
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Couverture taxonomique
Archaea
Domain | Archaea (Archaea) |
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Données sur le projet
Pas de description disponible
Titre | Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments |
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Financement | 454 pyrosequencing was supported by the K&A Wallemberg foundation. This work is a contribution to the International Polar Year–CFL system study (2007/2008) supported through grants from the Canadian International Polar Year Federal Program Office and the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Canada, the Spanish Ministry of Science and Innovation Grant Boreal CLG2007-28872-E/ANT, and the Swedish Research Council. Additional support was given by the Marie Curiellowship PIEFGA-2008-221121 and a “Juan de la Cierva” contract from the Spanish Ministry of Science and Innovation. We acknowledge support by the National Science Foundation Antarctic Organisms and Ecosystems ProgramGrants ANT-0741409 and ANT-08361440; Swedish Research Council Environment, Agricultural Sciences, and Spatial Planning Grant 217- 2006-342; and NSERC of Canada. |
Les personnes impliquées dans le projet:
Méthodes d'échantillonnage
Samples were collected by using a ship-deployed rosette for open water sampling and through the ship’s internal moon pool for winter ice-covered sampling.
Etendue de l'étude | Water samples were collected near the surface and in deeper halocline waters from the Arctic Southeast Beaufort Sea during the overwintering CFL cruise and in the upper 500 m from the Antarctic Amundsen and Ross seas during the summer in the Oden Southern Ocean cruise. |
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Description des étapes de la méthode:
- details are given in: https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2012/09/27/1201914109.DCSupplemental/sapp.pdf
Citations bibliographiques
- Alonso-Sáez, L., Waller, A. S., Mende, D. R., Bakker, K., Farnelid, H., Yager, P. L., ... & Estrada, M. (2012). Role for urea in nitrification by polar marine Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(44), 17989-17994.
Métadonnées additionnelles
Identifiants alternatifs | 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3 |
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https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea |