High gene flow in polar cod (Boreogadus saida) from West-Svalbard and the Eurasian Basin - Occurrence Data

Occurrence
Dernière version Publié par SCAR - AntOBIS le févr. 23, 2021 SCAR - AntOBIS
Date de publication:
23 février 2021
Publié par:
SCAR - AntOBIS
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

Occurende data of polar cod Boreogadus saida (Lepechin, 1744; Gadidae; also referred to as ‘Arctic cod’)used for micro satellite analysis in High gene flow in polar cod (Boreogadus saida) from West-Svalbard and the Eurasian Basin by Maes et al 2021. A total of 171 juvenile polar cod were collected from various fjords off West-Svalbard (Billefjorden, Hornsund and Kongsfjorden), the northern Sophia Basin and the Eurasian Basin of the Arctic Ocean, was analysed using nine DNA microsatellite loci.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 171 enregistrements.

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Maes S M, Christiansen H, Mark F C, Lucassen M, Van de Putte A, Volckaert F A, Flores H (2021): High gene flow in polar cod (Boreogadus saida) from West-Svalbard and the Eurasian Basin - Occurrence Data. v1.1. SCAR - AntOBIS. Dataset/Occurrence. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=polarcod_microsat_maeseta2021&v=1.1

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - AntOBIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : a29805e7-cfe2-4fcd-8510-0373ea480e16.  SCAR - AntOBIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Ocean Biodiversity Information System.

Mots-clé

Occurrence; Specimen; Central Arctic Ocean; Connectivity; microsatellites; Population differentiation; Population structure

Contacts

Sarah M. Maes
  • Créateur
  • Personne De Contact
Laboratory of Biodiversity and Evolutionary Genomics, KU Leuven
Charles Deberiotstraat 32
B-3000 Leuven
BE
Henrik Christiansen
  • Créateur
Laboratory of Biodiversity and Evolutionary Genomics, KU Leuven
Charles Deberiotstraat 32
B-3000 Leuven
BE
Felix C. Mark
  • Créateur
Alfred-Wegener Institute, Helmholtz Centre for Polar and Marine Research
Am Handelshafen 12
D-27570 Bremerhaven
DE
Magnus Lucassen
  • Créateur
Alfred-Wegener Institute, Helmholtz Centre for Polar and Marine Research
Am Handelshafen 12
D-27570 Bremerhaven
DE
Anton Van de Putte
  • Créateur
  • Utilisateur
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Vautiersstraat 29
B-1000 Brussels
BE
Filip A.M. Volckaert
  • Créateur
Laboratory of Biodiversity and Evolutionary Genomics, KU Leuven
Charles Deberiotstraat 32
B-3000 Leuven
BE
Hauke Flores
  • Créateur
Alfred-Wegener Institute, Helmholtz Centre for Polar and Marine Research
Am Handelshafen 12
D-27570 Bremerhaven
DE
Sarah Maes
  • Fournisseur Des Métadonnées
Investigatior
Laboratory of Biodiversity and Evolutionary Genomics, KU Leuven
Charles Deberiotstraat 32
B-3000 Leuven
BE

Couverture géographique

Central Arctic Ocean

Enveloppe géographique Sud Ouest [75, 5], Nord Est [85, 135]

Couverture taxonomique

Polar cod Boreogadus saida (Lepechin, 1774)

Species Boreogadus saida (Lepechin, 1774) (Polar cod)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2012-08-07 / 2015-06-19

Données sur le projet

This study was conducted under the Helmholtz Association Research Programme Polar regions And Coasts in the changing Earth System II (PACES II), Topic 1, WP 4 and is part of the Helmholtz Association Young Investigators Group Iceflux: Ice-ecosystem carbon flux in polar oceans (VH-NG-800).

Titre Polar regions And Coasts in the changing Earth System II (PACES II)
Identifiant VH-NG-800
Financement The SUIT net was developed by Wageningen Marine Research (formerly IMARES) with support from the Netherlands Ministry of LNV (projects WOT-04-009-036 and WOT-04-009-047.04) and the Netherlands Polar Program (NWO project ALW 866.13.009), which also supported research during Polarstern expeditions PS80 and PS92. ). SUIT operations and sampling during PS80 and PS92 were conducted by Michiel van Dorssen (Van Dorssen Metaalbewerking), André Meijboom (WMR), Carmen David (AWI), Benjamin Lange (AWI), Giulia Castellani (AWI), Martina Vortkamp (AWI), Antonia Immerz (AWI), Sarah Zwicker (AWI) and Fokje Schaafsma (WMR) with the assistance of colleague researchers on board. We thank Jutta Jürgens (AWI) and Bart Hellemans (KU Leuven) for assistance with the laboratory work. The authors declare that they have no conflict of interest. Herik Christiansen was supported by a grant from the former Flemish Agency for Innovation by Science and Technology, now Flanders Innovation & Entrepreneurship (VLAIO, grant no. 141328). Sarah Maes is funded by a Research Foundation Flanders grant for strategic basic research (FWO-SB, grant no. 1S04418N).

Les personnes impliquées dans le projet:

Sarah M. Maes

Méthodes d'échantillonnage

Sampling was conducted using a SUIT or bottom trawl (BT) with the RVs Helmer Hansen (HH), Heincke (HE) and Polarstern (PS) during four expeditions between 2012 and 2015 (Boetius 2013; Mark 2013; Peeken 2016;

Etendue de l'étude Offshore regions and fjords of Svalbard were sampled. This includes Billefjorden and Hornsund and Kongsfjorden fjords. In the Eurasian Basin, samples were collected in the Amundsen and Nansen Basin .

Description des étapes de la méthode:

  1. /

Citations bibliographiques

  1. Maes S.M. , Christiansen H., Mark F.C. , Lucassen M , Van de Putte A.P. , Volckaert F.A.M., Flores H. (2021) High gene flow in polar cod (Boreogadus saida) from West-Svalbard and the Eurasian Basin. Journal of Fish Biology doi: 10.1111/jfb.14697. 10.1111/jfb.14697

Métadonnées additionnelles

The microsatellite trace files, Genepop file, metadata and R markdown that support the findings of this study are available on Zenodo 10.5281/zenodo.4557603​