Métadonnées uniquement

Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments

Dernière version Publié par SCAR - Microbial Antarctic Resource System le 19 mars 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Date de publication:
19 mars 2019
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

Microbial dataset containing sequenced genes (ureC gene) from Thaumarchaeota from the Beaufort Sea (Arctic) and the Amundsen Sea (Antarctica), as well as a metagenome (454 pyrosequencing) the Beaufort Sea.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Alonso-Saez L, Waller A, Bakker K, Farnelid H, Yager P, Lovejoy C, Tremblay J, Potvin M, Heinrich F, Estrada M, Riemann L, Bork P, Pedros-Alio C, Bertilsson S (2019): Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments. v1.1. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea&v=1.1

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Scientific Committee on Antarctic Research.

Mots-clé

Metadata

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:
-

Laura Alonso-Saez
Uppsala University
Uppsala
SE
Alion Waller
European Molecular Biology Laboratory
Heidelberg
DE
Kevin Bakker
University of Michigan
Ann Arbor
US
Hanna Farnelid
Linnaeus University
Kalmar
SE
Patricia Yager
University of Georgia
Athens
US
Connie Lovejoy
Université Laval
Québec
CA
Jean-Eric Tremblay
Université Laval
Québec
CA
Marianne Potvin
Université Laval
Québec
CA
Frederike Heinrich
Uppsala University
Uppsala
SE
Marta Estrada
Institut de Ciències del Mar
Barcelona
ES
Lasse Riemann
University of Copenhagen
Helsingør
DK
Peer Bork
European Molecular Biology Laboratory
Heidelberg
DE
Carlos Pedros-Alio
Institut de Ciències del Mar
Barcelona
ES
Stefan Bertilsson
Uppsala University
Uppsala
SE

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Laura Alonso-Saez
Uppsala University
Uppsala
SE

Personne ayant renseigné les métadonnées:
-

Maxime Sweetlove
Research assistent
Royal Belgian Institute for Natural Sciences
1000 Brussels
BE

Autres personnes associées à la ressource:

Utilisateur

Couverture géographique

Amundsen Sea (Antarctica, Southern Ocean); Beaufort Sea (Arctic)

Enveloppe géographique Sud Ouest [-77,02, -123,897], Nord Est [71,033, 170,5]

Couverture taxonomique

Archaea

Domain Archaea (Archaea)

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments
Financement 454 pyrosequencing was supported by the K&A Wallemberg foundation. This work is a contribution to the International Polar Year–CFL system study (2007/2008) supported through grants from the Canadian International Polar Year Federal Program Office and the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Canada, the Spanish Ministry of Science and Innovation Grant Boreal CLG2007-28872-E/ANT, and the Swedish Research Council. Additional support was given by the Marie Curiellowship PIEFGA-2008-221121 and a “Juan de la Cierva” contract from the Spanish Ministry of Science and Innovation. We acknowledge support by the National Science Foundation Antarctic Organisms and Ecosystems ProgramGrants ANT-0741409 and ANT-08361440; Swedish Research Council Environment, Agricultural Sciences, and Spatial Planning Grant 217- 2006-342; and NSERC of Canada.

Les personnes impliquées dans le projet:

Laura Alonso-Saez

Méthodes d'échantillonnage

Samples were collected by using a ship-deployed rosette for open water sampling and through the ship’s internal moon pool for winter ice-covered sampling.

Etendue de l'étude Water samples were collected near the surface and in deeper halocline waters from the Arctic Southeast Beaufort Sea during the overwintering CFL cruise and in the upper 500 m from the Antarctic Amundsen and Ross seas during the summer in the Oden Southern Ocean cruise.

Description des étapes de la méthode:

  1. details are given in: https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2012/09/27/1201914109.DCSupplemental/sapp.pdf

Citations bibliographiques

  1. Alonso-Sáez, L., Waller, A. S., Mende, D. R., Bakker, K., Farnelid, H., Yager, P. L., ... & Estrada, M. (2012). Role for urea in nitrification by polar marine Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(44), 17989-17994.

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3
https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea