Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments

Metadata-only
Последняя версия опубликовано SCAR - Microbial Antarctic Resource System мар. 19, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Дата публикации:
19 марта 2019 г.
Опубликовано:
SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию метаданных ресурса (только метаданные) в формате EML или RTF:

Метаданные в формате EML Скачать в English (11 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Описание

Microbial dataset containing sequenced genes (ureC gene) from Thaumarchaeota from the Beaufort Sea (Arctic) and the Amundsen Sea (Antarctica), as well as a metagenome (454 pyrosequencing) the Beaufort Sea.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Alonso-Saez L, Waller A, Bakker K, Farnelid H, Yager P, Lovejoy C, Tremblay J, Potvin M, Heinrich F, Estrada M, Riemann L, Bork P, Pedros-Alio C, Bertilsson S (2019): Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments. v1.1. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea&v=1.1

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Scientific Committee on Antarctic Research.

Ключевые слова

Metadata

Контакты

Laura Alonso-Saez
  • Originator ●
  • Point Of Contact
Uppsala University
Uppsala
SE
Alion Waller
  • Originator
European Molecular Biology Laboratory
Heidelberg
DE
Kevin Bakker
  • Originator
University of Michigan
Ann Arbor
US
Hanna Farnelid
  • Originator
Linnaeus University
Kalmar
SE
Patricia Yager
  • Originator
University of Georgia
Athens
US
Connie Lovejoy
  • Originator
Université Laval
Québec
CA
Jean-Eric Tremblay
  • Originator
Université Laval
Québec
CA
Marianne Potvin
  • Originator
Université Laval
Québec
CA
Frederike Heinrich
  • Originator
Uppsala University
Uppsala
SE
Marta Estrada
  • Originator
Institut de Ciències del Mar
Barcelona
ES
Lasse Riemann
  • Originator
University of Copenhagen
Helsingør
DK
Peer Bork
  • Originator
European Molecular Biology Laboratory
Heidelberg
DE
Carlos Pedros-Alio
  • Originator
Institut de Ciències del Mar
Barcelona
ES
Stefan Bertilsson
  • Originator
Uppsala University
Uppsala
SE
Maxime Sweetlove
  • Metadata Provider
  • Research assistent
Royal Belgian Institute for Natural Sciences
1000 Brussels
BE

Географический охват

Amundsen Sea (Antarctica, Southern Ocean); Beaufort Sea (Arctic)

Ограничивающие координаты Юг Запад [-77,02, -123,897], Север Восток [71,033, 170,5]

Таксономический охват

Archaea

Domain Archaea (Archaea)

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments
Финансирование 454 pyrosequencing was supported by the K&A Wallemberg foundation. This work is a contribution to the International Polar Year–CFL system study (2007/2008) supported through grants from the Canadian International Polar Year Federal Program Office and the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Canada, the Spanish Ministry of Science and Innovation Grant Boreal CLG2007-28872-E/ANT, and the Swedish Research Council. Additional support was given by the Marie Curiellowship PIEFGA-2008-221121 and a “Juan de la Cierva” contract from the Spanish Ministry of Science and Innovation. We acknowledge support by the National Science Foundation Antarctic Organisms and Ecosystems ProgramGrants ANT-0741409 and ANT-08361440; Swedish Research Council Environment, Agricultural Sciences, and Spatial Planning Grant 217- 2006-342; and NSERC of Canada.

Исполнители проекта:

Laura Alonso-Saez

Методы сбора

Samples were collected by using a ship-deployed rosette for open water sampling and through the ship’s internal moon pool for winter ice-covered sampling.

Охват исследования Water samples were collected near the surface and in deeper halocline waters from the Arctic Southeast Beaufort Sea during the overwintering CFL cruise and in the upper 500 m from the Antarctic Amundsen and Ross seas during the summer in the Oden Southern Ocean cruise.

Описание этапа методики:

  1. details are given in: https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2012/09/27/1201914109.DCSupplemental/sapp.pdf

Библиографические ссылки

  1. Alonso-Sáez, L., Waller, A. S., Mende, D. R., Bakker, K., Farnelid, H., Yager, P. L., ... & Estrada, M. (2012). Role for urea in nitrification by polar marine Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(44), 17989-17994.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3
https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea