Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments

Последняя версия опубликована SCAR - Microbial Antarctic Resource System Mar 19, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

Microbial dataset containing sequenced genes (ureC gene) from Thaumarchaeota from the Beaufort Sea (Arctic) and the Amundsen Sea (Antarctica), as well as a metagenome (454 pyrosequencing) the Beaufort Sea.

Загрузки

Скачайте последнюю версию метаданных ресурса (только метаданные) в формате EML или RTF:

Метаданные в формате EML Скачать в English (11 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (10 KB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Alonso-Saez L, Waller A, Bakker K, Farnelid H, Yager P, Lovejoy C, Tremblay J, Potvin M, Heinrich F, Estrada M, Riemann L, Bork P, Pedros-Alio C, Bertilsson S (2019): Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments. v1.1. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea&v=1.1

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Scientific Committee on Antarctic Research.

Ключевые слова

Metadata

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Laura Alonso-Saez
Uppsala University Uppsala SE
Alion Waller
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg DE
Kevin Bakker
University of Michigan Ann Arbor US
Hanna Farnelid
Linnaeus University Kalmar SE
Patricia Yager
University of Georgia Athens US
Connie Lovejoy
Université Laval Québec CA
Jean-Eric Tremblay
Université Laval Québec CA
Marianne Potvin
Université Laval Québec CA
Frederike Heinrich
Uppsala University Uppsala SE
Marta Estrada
Institut de Ciències del Mar Barcelona ES
Lasse Riemann
University of Copenhagen Helsingør DK
Peer Bork
European Molecular Biology Laboratory Heidelberg DE
Carlos Pedros-Alio
Institut de Ciències del Mar Barcelona ES
Stefan Bertilsson
Uppsala University Uppsala SE

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Laura Alonso-Saez
Uppsala University Uppsala SE

Кем заполнены метаданные:

Maxime Sweetlove
Research assistent
Royal Belgian Institute for Natural Sciences 1000 Brussels BE

Кто еще связан с данным ресурсом:

User

Географический охват

Amundsen Sea (Antarctica, Southern Ocean); Beaufort Sea (Arctic)

Ограничивающие координаты Юг Запад [-77.02, -123.897], Север Восток [71.033, 170.5]

Таксономический охват

Archaea

Domain  Archaea (Archaea)

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название Sequenced genes (ureC gene) and a metagenome from Archaea in Arctic and Antarctic marine environments
Финансирование 454 pyrosequencing was supported by the K&A Wallemberg foundation. This work is a contribution to the International Polar Year–CFL system study (2007/2008) supported through grants from the Canadian International Polar Year Federal Program Office and the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) Canada, the Spanish Ministry of Science and Innovation Grant Boreal CLG2007-28872-E/ANT, and the Swedish Research Council. Additional support was given by the Marie Curiellowship PIEFGA-2008-221121 and a “Juan de la Cierva” contract from the Spanish Ministry of Science and Innovation. We acknowledge support by the National Science Foundation Antarctic Organisms and Ecosystems ProgramGrants ANT-0741409 and ANT-08361440; Swedish Research Council Environment, Agricultural Sciences, and Spatial Planning Grant 217- 2006-342; and NSERC of Canada.

Исполнители проекта:

Laura Alonso-Saez

Методы сбора

Samples were collected by using a ship-deployed rosette for open water sampling and through the ship’s internal moon pool for winter ice-covered sampling.

Охват исследования Water samples were collected near the surface and in deeper halocline waters from the Arctic Southeast Beaufort Sea during the overwintering CFL cruise and in the upper 500 m from the Antarctic Amundsen and Ross seas during the summer in the Oden Southern Ocean cruise.

Описание этапа методики:

  1. details are given in: https://www.pnas.org/content/pnas/suppl/2012/09/27/1201914109.DCSupplemental/sapp.pdf

Библиографические ссылки

  1. Alonso-Sáez, L., Waller, A. S., Mende, D. R., Bakker, K., Farnelid, H., Yager, P. L., ... & Estrada, M. (2012). Role for urea in nitrification by polar marine Archaea. Proceedings of the National Academy of Sciences, 109(44), 17989-17994.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 53fb0f04-3ba5-4fe8-8ea4-0511914bd0c3
https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=arctic_antarctic_marine_archaea