Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data

Evento de muestreo
Última versión publicado por SCAR - AntOBIS el may 4, 2023 SCAR - AntOBIS
Fecha de publicación:
4 de mayo de 2023
Publicado por:
CC-BY 4.0

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 4.652 registros en Inglés (2 MB) - Frecuencia de actualización: desconocido
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Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (15 KB)


The global importance of mesopelagic fish is increasingly recognised, but they remain relatively poorly studied. This is particularly true in the Southern Ocean, where mesopelagic fishes are both key predators and prey, but where the remote environment makes sampling challenging. Despite this, multiple national Antarctic research programs have undertaken regional sampling of mesopelagic fish over several decades. However, data are dispersed, and sampling methodologies often differ precluding comparisons and limiting synthetic analyses. We identified potential data holders by compiling a metadata catalogue of existing survey data for Southern Ocean mesopelagic fishes. Data holders contributed 17,491 occurrence and 11,190 abundance records from 4780 net hauls from 72 different research cruises. Data span across 37 years from 1991 to 2019 and include trait-based information (length, weight, maturity). The final dataset underwent quality control processes and detailed metadata was provided for each sampling event. This dataset can be accessed through the Antarctic Biodiversity Portal. Myctobase will enhance research capacity by providing the broadscale baseline data necessary for observing and modelling mesopelagic fishes. The paper which this dataset refers to is available at The original dataset as submitted for the paper is also available on Zenodo at

This dataset is published by SCAR-AntOBIS under the license CC-BY 4.0. We would appreciate it if you could follow the guidelines from the SCAR and IPY Data Policies ( when using the data. If you have any questions regarding this dataset, please do not hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via Issues with dataset can be reported at This dataset is part of the Belgian contribution to the EU-Lifewatch project funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO, contract n°FR/36/AN1/AntaBIS) .


Los datos en este recurso de evento de muestreo han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 4.652 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Event (core)

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.


La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Woods B, Trebilco R, Walters A, Hindell M, Duhamel G, Flores H, Moteki M, Pruvost P, Reiss C, Saunders R, Sutton C, Gan Y, Van de Putte A (2023). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data. Version 1.1. SCAR - AntOBIS. Samplingevent dataset.


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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es SCAR - AntOBIS. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a.  SCAR - AntOBIS publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Ocean Biodiversity Information System.

Palabras clave



Briannyn Woods
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Originador
  • Punto De Contacto
University of Tasmania
Andrea Walters
  • Originador
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
Mark Hindell
  • Originador
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
Guy Duhamel
  • Originador
Muséum National d’Histoire Naturelle
Hauke Flores
  • Originador
Alfred-Wegener-Institut Helmholtz-Zentrum für Polar und Meeresforschung (AWI)
Masato Moteki
  • Originador
Tokyo University of Marine Science and Technology, National Institute of Polar Science
Patrice Pruvost
  • Originador
Muséum National d’Histoire Naturelle
Christian Reiss
  • Originador
Southwest Fisheries Science Center
Ryan Saunders
  • Originador
British Antarctic Survey
Caroline Sutton
  • Originador
Yi-Ming Gan
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Originador
  • Punto De Contacto
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Anton Van de Putte
  • Originador
Royal Belgian Institute of Natural Sciences

Cobertura geográfica

Scotia Sea, South Georgia and Shag Rocks, Antarctic Peninsula, Lazarev Sea, Kerguelen Plateau, Kerguelen Islands, Heard Island, East Antarctica, Macquarie Island, Indian Ocean

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-70,335, 0], Latitud Máxima Longitud Máxima [-40,002, 96,15]

Cobertura taxonómica

No hay descripción disponible

Reino Animalia
Filo Chordata, Ctenophora
Class Actinopteri, Cephalopoda

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1991-01-13 / 2019-01-18

Datos del proyecto

The long-term aims of Myctobase are 1) to provide a single findable, standardised, and citable resource for multiple combined datasets; 2) to provide the baseline data upon which to measure the status and future trends of the mesopelagic fish assemblage; 3) to support further research such as investigating the patterns and biophysical drivers of diversity; and 4) to provide the broadscale spatiotemporal perspective necessary for the holistic management and conservation of the open-ocean pelagic ecosystem in the Southern Ocean.

Título Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields
Fuentes de Financiación This project is funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO). Grant number: contract n°FR/36/AN1/AntaBIS

Personas asociadas al proyecto:

Anton Van de Putte

Referencias bibliográficas

  1. Woods, Briannyn, Trebilco, Rowan, Walters, Andrea, Hindell, Mark, Duhamel, Guy, Flores, Hauke, Moteki, Masato, Pruvost, Patrice, Reiss, Christian, Saunders, Ryan, Sutton, Caroline, & Van de Putte, Anton. (2021). Myctobase (1.1) [Data set]. Zenodo.
  2. Collins, Martin A.;Piatkowski, Uwe;Saunders, Ryan A. (2021) Distribution of mesopelagic fish in the Scotia Sea from RMT25 and pelagic trawls deployed from RRS James Clark Ross and RRS John Biscoe. Polar Data Centre, Natural Environment Research Council,UK Research & Innovation.
  3. Australian Antarctic Data Centre (2019). Fish and zooplankton from RMT-8 net hauls on the BROKE voyage. Occurrence dataset accessed via on 2022-05-09.
  4. Sutton, Caroline; Kloser, Rudy; Gershwin, Lisa. Micronekton in southern Australia and the Southern Ocean: A collation of the biomass, abundance, diversity and distribution data from CSIRO’s historical mesopelagic depth stratified net samples.. Hobart: CSIRO; 2018.
  5. Constable, A., Williams, D. and Lamb, T. (2018) Heard Island and McDonald Islands (HIMI) Marine Ecosystem, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09
  6. Van de Putte, A. (2010) Fish catches from Rectangular Midwater Trawl - data collected from the BROKE-West voyage of the Aurora Australis, 2006, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09
  7. Woods, B., Trebilco, R., Walters, A., Hindell, M., Duhamel, G., Flores, H., Moteki, M., Pruvost, P., Reiss, C., Saunders, R. A., Sutton, C., Yi-Ming Gan,& Van de Putte, A. (2022). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields. Scientific Data.

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a