Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data

Données d'échantillonnage
Dernière version Publié par SCAR - AntOBIS le mai 4, 2023 SCAR - AntOBIS
Accueil:
https://doi.org/10.1038/s41597-022-01496-y
Date de publication:
4 mai 2023
Publié par:
SCAR - AntOBIS
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

The global importance of mesopelagic fish is increasingly recognised, but they remain relatively poorly studied. This is particularly true in the Southern Ocean, where mesopelagic fishes are both key predators and prey, but where the remote environment makes sampling challenging. Despite this, multiple national Antarctic research programs have undertaken regional sampling of mesopelagic fish over several decades. However, data are dispersed, and sampling methodologies often differ precluding comparisons and limiting synthetic analyses. We identified potential data holders by compiling a metadata catalogue of existing survey data for Southern Ocean mesopelagic fishes. Data holders contributed 17,491 occurrence and 11,190 abundance records from 4780 net hauls from 72 different research cruises. Data span across 37 years from 1991 to 2019 and include trait-based information (length, weight, maturity). The final dataset underwent quality control processes and detailed metadata was provided for each sampling event. This dataset can be accessed through the Antarctic Biodiversity Portal. Myctobase will enhance research capacity by providing the broadscale baseline data necessary for observing and modelling mesopelagic fishes. The paper which this dataset refers to is available at https://doi.org/10.1038/s41597-022-01496-y. The original dataset as submitted for the paper is also available on Zenodo at https://doi.org/10.5281/zenodo.6131579.

This dataset is published by SCAR-AntOBIS under the license CC-BY 4.0. We would appreciate it if you could follow the guidelines from the SCAR and IPY Data Policies (https://www.scar.org/excom-meetings/xxxi-scar-delegates-2010-buenos-aires-argentina/4563-scar-xxxi-ip04b-scar-data-policy/file/) when using the data. If you have any questions regarding this dataset, please do not hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via data-biodiversity-aq@naturalsciences.be. Issues with dataset can be reported at https://github.com/biodiversity-aq/data-publication/ This dataset is part of the Belgian contribution to the EU-Lifewatch project funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO, contract n°FR/36/AN1/AntaBIS) .

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 4 652 enregistrements.

2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
4652
ExtendedMeasurementOrFact 
148294
Occurrence 
54103

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Woods B, Trebilco R, Walters A, Hindell M, Duhamel G, Flores H, Moteki M, Pruvost P, Reiss C, Saunders R, Sutton C, Gan Y, Van de Putte A (2023). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data. Version 1.1. SCAR - AntOBIS. Samplingevent dataset. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=myctobase&v=1.1

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - AntOBIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a.  SCAR - AntOBIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Ocean Biodiversity Information System.

Mots-clé

Samplingevent; SOUTHERN OCEAN; OCEANIC ZONE; PELAGIC; MIDWATER TRAWLS; POPULATION ABUNDANCE; TRAWL; ANTARCTIC; MESOPELAGIC; LANTERNFISH; MYCTOPHIDAE; BATHYLAGIDAE; BIOMASS; ABUNDANCE; WEIGHT; LENGTH; BIOMASS

Contacts

Briannyn Woods
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
University of Tasmania
AU
Rowan Trebilco
  • Créateur
CSIRO
AU
Andrea Walters
  • Créateur
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
AU
Mark Hindell
  • Créateur
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
AU
Guy Duhamel
  • Créateur
Muséum National d’Histoire Naturelle
FR
Hauke Flores
  • Créateur
Alfred-Wegener-Institut Helmholtz-Zentrum für Polar und Meeresforschung (AWI)
DE
Masato Moteki
  • Créateur
Tokyo University of Marine Science and Technology, National Institute of Polar Science
JP
Patrice Pruvost
  • Créateur
Muséum National d’Histoire Naturelle
FR
Christian Reiss
  • Créateur
Southwest Fisheries Science Center
US
Ryan Saunders
  • Créateur
British Antarctic Survey
GB
Caroline Sutton
  • Créateur
CSIRO
AU
Yi-Ming Gan
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
BE
Anton Van de Putte
  • Créateur
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
BE

Couverture géographique

Scotia Sea, South Georgia and Shag Rocks, Antarctic Peninsula, Lazarev Sea, Kerguelen Plateau, Kerguelen Islands, Heard Island, East Antarctica, Macquarie Island, Indian Ocean

Enveloppe géographique Sud Ouest [-70,335, 0], Nord Est [-40,002, 96,15]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Kingdom Animalia
Phylum Chordata, Ctenophora
Class Actinopteri, Cephalopoda

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1991-01-13 / 2019-01-18

Données sur le projet

The long-term aims of Myctobase are 1) to provide a single findable, standardised, and citable resource for multiple combined datasets; 2) to provide the baseline data upon which to measure the status and future trends of the mesopelagic fish assemblage; 3) to support further research such as investigating the patterns and biophysical drivers of diversity; and 4) to provide the broadscale spatiotemporal perspective necessary for the holistic management and conservation of the open-ocean pelagic ecosystem in the Southern Ocean.

Titre Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields
Financement This project is funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO). Grant number: contract n°FR/36/AN1/AntaBIS

Les personnes impliquées dans le projet:

Briannyn Woods
  • Auteur
Anton Van de Putte
  • Chercheur Principal

Citations bibliographiques

  1. Woods, Briannyn, Trebilco, Rowan, Walters, Andrea, Hindell, Mark, Duhamel, Guy, Flores, Hauke, Moteki, Masato, Pruvost, Patrice, Reiss, Christian, Saunders, Ryan, Sutton, Caroline, & Van de Putte, Anton. (2021). Myctobase (1.1) [Data set]. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.5590999
  2. Collins, Martin A.;Piatkowski, Uwe;Saunders, Ryan A. (2021) Distribution of mesopelagic fish in the Scotia Sea from RMT25 and pelagic trawls deployed from RRS James Clark Ross and RRS John Biscoe. Polar Data Centre, Natural Environment Research Council,UK Research & Innovation. https://doi.org/10.5285/f4dfc0ee-4f61-47c5-a5a8-238e02ff2fdd
  3. Australian Antarctic Data Centre (2019). Fish and zooplankton from RMT-8 net hauls on the BROKE voyage. Occurrence dataset accessed via GBIF.org on 2022-05-09. https://doi.org/10.15468/xenwtm
  4. Sutton, Caroline; Kloser, Rudy; Gershwin, Lisa. Micronekton in southern Australia and the Southern Ocean: A collation of the biomass, abundance, diversity and distribution data from CSIRO’s historical mesopelagic depth stratified net samples.. Hobart: CSIRO; 2018. http://hdl.handle.net/102.100.100/365479?index=1
  5. Constable, A., Williams, D. and Lamb, T. (2018) Heard Island and McDonald Islands (HIMI) Marine Ecosystem, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09 https://doi.org/10.4225/15/5b31be45e8977
  6. Van de Putte, A. (2010) Fish catches from Rectangular Midwater Trawl - data collected from the BROKE-West voyage of the Aurora Australis, 2006, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09 https://doi.org/10.4225/15/598d453109182
  7. Woods, B., Trebilco, R., Walters, A., Hindell, M., Duhamel, G., Flores, H., Moteki, M., Pruvost, P., Reiss, C., Saunders, R. A., Sutton, C., Yi-Ming Gan,& Van de Putte, A. (2022). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields. Scientific Data. https://doi.org/10.1038/s41597-022-01496-y

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a
https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=myctobase