Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data

Sampling event
Последняя версия опубликовано SCAR - AntOBIS мая 4, 2023 SCAR - AntOBIS
Дата публикации:
4 мая 2023 г.
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 4 652 Записи в English (2 MB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (23 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (15 KB)


The global importance of mesopelagic fish is increasingly recognised, but they remain relatively poorly studied. This is particularly true in the Southern Ocean, where mesopelagic fishes are both key predators and prey, but where the remote environment makes sampling challenging. Despite this, multiple national Antarctic research programs have undertaken regional sampling of mesopelagic fish over several decades. However, data are dispersed, and sampling methodologies often differ precluding comparisons and limiting synthetic analyses. We identified potential data holders by compiling a metadata catalogue of existing survey data for Southern Ocean mesopelagic fishes. Data holders contributed 17,491 occurrence and 11,190 abundance records from 4780 net hauls from 72 different research cruises. Data span across 37 years from 1991 to 2019 and include trait-based information (length, weight, maturity). The final dataset underwent quality control processes and detailed metadata was provided for each sampling event. This dataset can be accessed through the Antarctic Biodiversity Portal. Myctobase will enhance research capacity by providing the broadscale baseline data necessary for observing and modelling mesopelagic fishes. The paper which this dataset refers to is available at The original dataset as submitted for the paper is also available on Zenodo at

This dataset is published by SCAR-AntOBIS under the license CC-BY 4.0. We would appreciate it if you could follow the guidelines from the SCAR and IPY Data Policies ( when using the data. If you have any questions regarding this dataset, please do not hesitate to contact us via the contact information provided in the metadata or via Issues with dataset can be reported at This dataset is part of the Belgian contribution to the EU-Lifewatch project funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO, contract n°FR/36/AN1/AntaBIS) .

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 4 652 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.


В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Woods B, Trebilco R, Walters A, Hindell M, Duhamel G, Flores H, Moteki M, Pruvost P, Reiss C, Saunders R, Sutton C, Gan Y, Van de Putte A (2023). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields - data. Version 1.1. SCAR - AntOBIS. Samplingevent dataset.


Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является SCAR - AntOBIS. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a.  SCAR - AntOBIS отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Ocean Biodiversity Information System.

Ключевые слова



Briannyn Woods
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
University of Tasmania
Andrea Walters
  • Originator
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
Mark Hindell
  • Originator
Institute for Marine and Antarctic Studies, University of Tasmania
Guy Duhamel
  • Originator
Muséum National d’Histoire Naturelle
Hauke Flores
  • Originator
Alfred-Wegener-Institut Helmholtz-Zentrum für Polar und Meeresforschung (AWI)
Masato Moteki
  • Originator
Tokyo University of Marine Science and Technology, National Institute of Polar Science
Patrice Pruvost
  • Originator
Muséum National d’Histoire Naturelle
Christian Reiss
  • Originator
Southwest Fisheries Science Center
Ryan Saunders
  • Originator
British Antarctic Survey
Caroline Sutton
  • Originator
Yi-Ming Gan
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Anton Van de Putte
  • Originator
Royal Belgian Institute of Natural Sciences

Географический охват

Scotia Sea, South Georgia and Shag Rocks, Antarctic Peninsula, Lazarev Sea, Kerguelen Plateau, Kerguelen Islands, Heard Island, East Antarctica, Macquarie Island, Indian Ocean

Ограничивающие координаты Юг Запад [-70,335, 0], Север Восток [-40,002, 96,15]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Kingdom Animalia
Phylum Chordata, Ctenophora
Class Actinopteri, Cephalopoda

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1991-01-13 / 2019-01-18

Данные проекта

The long-term aims of Myctobase are 1) to provide a single findable, standardised, and citable resource for multiple combined datasets; 2) to provide the baseline data upon which to measure the status and future trends of the mesopelagic fish assemblage; 3) to support further research such as investigating the patterns and biophysical drivers of diversity; and 4) to provide the broadscale spatiotemporal perspective necessary for the holistic management and conservation of the open-ocean pelagic ecosystem in the Southern Ocean.

Название Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields
Финансирование This project is funded by the Belgian Science Policy Office (BELSPO). Grant number: contract n°FR/36/AN1/AntaBIS

Исполнители проекта:

Anton Van de Putte

Библиографические ссылки

  1. Woods, Briannyn, Trebilco, Rowan, Walters, Andrea, Hindell, Mark, Duhamel, Guy, Flores, Hauke, Moteki, Masato, Pruvost, Patrice, Reiss, Christian, Saunders, Ryan, Sutton, Caroline, & Van de Putte, Anton. (2021). Myctobase (1.1) [Data set]. Zenodo.
  2. Collins, Martin A.;Piatkowski, Uwe;Saunders, Ryan A. (2021) Distribution of mesopelagic fish in the Scotia Sea from RMT25 and pelagic trawls deployed from RRS James Clark Ross and RRS John Biscoe. Polar Data Centre, Natural Environment Research Council,UK Research & Innovation.
  3. Australian Antarctic Data Centre (2019). Fish and zooplankton from RMT-8 net hauls on the BROKE voyage. Occurrence dataset accessed via on 2022-05-09.
  4. Sutton, Caroline; Kloser, Rudy; Gershwin, Lisa. Micronekton in southern Australia and the Southern Ocean: A collation of the biomass, abundance, diversity and distribution data from CSIRO’s historical mesopelagic depth stratified net samples.. Hobart: CSIRO; 2018.
  5. Constable, A., Williams, D. and Lamb, T. (2018) Heard Island and McDonald Islands (HIMI) Marine Ecosystem, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09
  6. Van de Putte, A. (2010) Fish catches from Rectangular Midwater Trawl - data collected from the BROKE-West voyage of the Aurora Australis, 2006, Ver. 1, Australian Antarctic Data Centre, Accessed: 2022-05-09
  7. Woods, B., Trebilco, R., Walters, A., Hindell, M., Duhamel, G., Flores, H., Moteki, M., Pruvost, P., Reiss, C., Saunders, R. A., Sutton, C., Yi-Ming Gan,& Van de Putte, A. (2022). Myctobase, a circumpolar database of mesopelagic fishes for new insights into deep pelagic prey fields. Scientific Data.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 2ecef267-0e17-4f3f-adf9-20b036e6167a