Protist diversity in a permanently ice-covered Antarctic Lake during the polar night transition

メタデータ
最新バージョン SCAR - Microbial Antarctic Resource System により出版 6月 8, 2021 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
公開日:
2021年6月8日
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

Amplicon sequencing dataset targeting eukaryote microorganisms (18S ssu rRNA marker gene) in permanently ice-covered lakes in the McMurdo Dry Valleys (Antarctica). Samples (n=89) were taken in the photic zone of the east lobe (ELB) and west lobe (WLB) of the chemically stratified Lake Bonney.

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Bielewicz S, Bell E, Kong W, Froedberg I, Priscu J, Morgan-Kiss R (2021): Protist diversity in a permanently ice-covered Antarctic Lake during the polar night transition. v1.1. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Metadata. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=protist_diversity_in_antarctic_lake_during_polar_night&v=1.1

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は SCAR - Microbial Antarctic Resource System。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 8d83b6ed-c88d-4bf6-90a2-c6ade46fee16が割り当てられています。   Scientific Committee on Antarctic Research によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSCAR - Microbial Antarctic Resource System が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Metadata

連絡先

Scott Bielewicz
  • 最初のデータ採集者
Miami University
Oxford
US
Elanor Bell
  • 最初のデータ採集者
Scottish Marine Institute
Argyll
GB
Weidong Kong
  • 最初のデータ採集者
Miami University
Oxford
US
Iddo Froedberg
  • 最初のデータ採集者
Miami University
Oxford
US
John Priscu
  • 最初のデータ採集者
Montana State University
Bozeman
US
Rachael Morgan-Kiss
  • 最初のデータ採集者 ●
  • データ利用者 ●
  • 連絡先
Miami University
Oxford
US
Maxime Sweetlove
  • メタデータ提供者
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Brussels
BE

地理的範囲

Lake Bonney, McMurdo Dry Valleys, Antarctica West = East =

座標（緯度経度） 南 西 [-77.435, 161.405], 北 東 [-77.316, 163.743]

時間的範囲

開始日 / 終了日 2010-11-18 / 2011-03-15

プロジェクトデータ

Mc Murdo Dry Valleys Long Term Ecological Research Project (LTER; http://www.mcmlter.org/)

タイトル Protist diversity in a permanently ice-covered Antarctic Lake during the polar night transition
ファンデイング National Science Foundation (NSF)

プロジェクトに携わる要員:

Rachael Morgan-Kiss

収集方法

Samples (1 liter) were vacuum concentrated (5 kPa) onto 47 mm 0.45 µm Durapore polyvinylidene fluoride membrane filters (Millipore). The filters were frozen immediately in liquid nitrogen and transported frozen to McMurdo Station, where they were stored at -80 degrees C until DNA extraction.

Study Extent Lake Bonney in the McMurdo Dry Valleys (Antarctica). Samples were collected at 6, 13, 18, and 20m in the east lobe (ELB) and 10, 13, 15, and 20m in the west lobe (WLB) of Lake Bonney from February to April 2008. All collection depths are relative to the piezometric water level in the ice borehole.

Method step description:

  1. DNA was isolated from a whole filter using the MP DNA kit (MP Biomedicals, CA) following the kit’s instruction. Sequencing was performed using the BigDye Terminator v3.1 cycle sequencing kit (ABI, CA) with M13R primer and the fragments were sequenced on an Applied Biosystems 3730×l DNA Analyzer (ABI, CA). The 18S rRNA gene sequences reported in the current study have been deposited in GenBank under accession numbers GU969060 to GU969102.

書誌情報の引用

  1. Bielewicz, S., Bell, E., Kong, W., Friedberg, I., Priscu, J. C., & Morgan-Kiss, R. M. (2011). Protist diversity in a permanently ice-covered Antarctic Lake during the polar night transition. The ISME Journal, 5(9), 1559–1564. doi:10.1038/ismej.2011.23