Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica

Última versión Publicado por SCAR - Microbial Antarctic Resource System en Jan 16, 2020 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

This dataset describes heterotrophic bacteria that were isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula.

Registros

Los datos en este evento de muestreo recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 9 registros. también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Event (core)
    9
  • Occurrence 
    504

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

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Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Peeters K (2020): Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. v1.0. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Samplingevent. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=heterotrophic_bacterial_isolates_in_antarctica_microbial_mats&v=1.0

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 74277118-41a6-4e2b-bfe3-4d002cca369f.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Scientific Committee on Antarctic Research.

Palabras Clave

Samplingevent

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Anne Willems
Ghent University Ghent BE

¿Quién documentó los metadatos?:

Maxime Sweetlove
Royal Belgian Institute of Natural Sciences Rue Vautier 29 1000 Brussels

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Usuario
Anne Willems
Ghent University Ghent BE
Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

Cobertura Geográfica

Different water bodies (lakes) on the Antarctic continent: East Antarctica, the Trans-Antarctic Mountains, and the Antarctic Peninsula

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-82.45, -67.45], Latitud Máxima Longitud Máxima [-67.7, 39.8]

Cobertura Taxonómica

Heterotrophic Bacteria (504 strains) isolated from frozen microbial mat samples using culturing techniques.

Reino  Bacteria (Bacteria)

Datos del Proyecto

The AMBIO project aimed to extend the baseline information of microbial diversity in aquatic habitats of terrestrial Antarctic environments.

Título Antarctic Microbial Biodiversity (AMBIO)
Fuentes de Financiación BelSPO SD/BA/01
Descripción del Área de Estudio the Antarctic continent.

Personas asociadas al proyecto:

Annick Wilmotte
Anne Willems
Elie Verleyen
Wim Vyverman

Métodos de Muestreo

Microbial mat samples were collected aseptically using a sterile spatula, and were kept frozen continuously after collection until processing in the laboratory.

Área de Estudio Bacterial strain isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula, sampled between 2003 and 2007.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. One gram of sample was aseptically weighed and homogenized in 9 ml sterile cold (4°C) physiological saline (0.86% NaCl) using a vortex. Tenfold dilution series (kept at 4°C) were plated on four different media (Marine agar 2216 (MA) (BD DifcoTM), R2A (BD DifcoTM), ten times diluted R2A (R2A/10), and PYGV (Pepton-Yeast-Glucose-Vitamin) medium (DSMZ medium 621)) and incubated at 20°C, 15°C and 4°C. R2A (Difco) contains pyruvate, starch and dextrose as C sources and yeast extract, peptone and casaminoacids as N and C sources and PYGV (DSMZ medium 621) contains peptone, yeast extract and glucose as C and/or N sources and additional vitamins and minerals. Both are considered oligotrophic media because the amounts of these components are at least two to ten times lower than in more general media such as nutrient broth. In addition to regular physiological saline (PS) dilution series, sea water (SW) dilutions were used for the LA3 and WO10 samples which originated from lakes close to the ocean and had elevated conductivity values.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección BCCM-LMG
Identificador de la Colección BCCM-LMG

Referencias Bibliográficas

  1. K. Peeters, E. Verleyen, D. A. Hodgson, P. Convey, D. Ertz , W. Vyverman, A. Willems (2012). Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. Polar Biol (2012) 35:543‐554. DOI 10.1007/s00300‐011‐1100‐4