Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica

Dernière version Publié par SCAR - Microbial Antarctic Resource System le Jan 16, 2020 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

This dataset describes heterotrophic bacteria that were isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 9 enregistrements. 1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

  • Event (noyau)
    9
  • Occurrence 
    504

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées des ressources sont disponibles au téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Téléchargements

Téléchargez la dernière version de la ressource en tant qu'Archive Darwin Core (DwC-A), ou les métadonnées de la ressource au format EML ou RTF :

Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 9 enregistrements dans Anglais (14 KB) - Fréquence de mise à jour: inconnue
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Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Peeters K (2020): Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. v1.0. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Samplingevent. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=heterotrophic_bacterial_isolates_in_antarctica_microbial_mats&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 74277118-41a6-4e2b-bfe3-4d002cca369f.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Scientific Committee on Antarctic Research.

Mots-clé

Samplingevent

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Anne Willems
Ghent University Ghent BE

Personne ayant renseigné les métadonnées:

Maxime Sweetlove
Royal Belgian Institute of Natural Sciences Rue Vautier 29 1000 Brussels

Autres personnes associées à la ressource:

Utilisateur
Anne Willems
Ghent University Ghent BE
Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

Couverture géographique

Different water bodies (lakes) on the Antarctic continent: East Antarctica, the Trans-Antarctic Mountains, and the Antarctic Peninsula

Enveloppe géographique Sud Ouest [-82.45, -67.45], Nord Est [-67.7, 39.8]

Couverture taxonomique

Heterotrophic Bacteria (504 strains) isolated from frozen microbial mat samples using culturing techniques.

Kingdom  Bacteria (Bacteria)

Données sur le projet

The AMBIO project aimed to extend the baseline information of microbial diversity in aquatic habitats of terrestrial Antarctic environments.

Titre Antarctic Microbial Biodiversity (AMBIO)
Financement BelSPO SD/BA/01
Description du domaine d'étude / de recherche the Antarctic continent.

Les personnes impliquées dans le projet:

Annick Wilmotte
Anne Willems
Elie Verleyen
Wim Vyverman

Méthodes d'échantillonnage

Microbial mat samples were collected aseptically using a sterile spatula, and were kept frozen continuously after collection until processing in the laboratory.

Etendue de l'étude Bacterial strain isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula, sampled between 2003 and 2007.

Description des étapes de la méthode:

  1. One gram of sample was aseptically weighed and homogenized in 9 ml sterile cold (4°C) physiological saline (0.86% NaCl) using a vortex. Tenfold dilution series (kept at 4°C) were plated on four different media (Marine agar 2216 (MA) (BD DifcoTM), R2A (BD DifcoTM), ten times diluted R2A (R2A/10), and PYGV (Pepton-Yeast-Glucose-Vitamin) medium (DSMZ medium 621)) and incubated at 20°C, 15°C and 4°C. R2A (Difco) contains pyruvate, starch and dextrose as C sources and yeast extract, peptone and casaminoacids as N and C sources and PYGV (DSMZ medium 621) contains peptone, yeast extract and glucose as C and/or N sources and additional vitamins and minerals. Both are considered oligotrophic media because the amounts of these components are at least two to ten times lower than in more general media such as nutrient broth. In addition to regular physiological saline (PS) dilution series, sea water (SW) dilutions were used for the LA3 and WO10 samples which originated from lakes close to the ocean and had elevated conductivity values.

Données de collection

Nom de la collection BCCM-LMG
Identifiant de collection BCCM-LMG

Citations bibliographiques

  1. K. Peeters, E. Verleyen, D. A. Hodgson, P. Convey, D. Ertz , W. Vyverman, A. Willems (2012). Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. Polar Biol (2012) 35:543‐554. DOI 10.1007/s00300‐011‐1100‐4