Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica

Последняя версия опубликована SCAR - Microbial Antarctic Resource System Jan 16, 2020 SCAR - Microbial Antarctic Resource System

This dataset describes heterotrophic bacteria that were isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula.

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 9 записей. Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

  • Event (core)
    9
  • Occurrence 
    504

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем (репозиторием) данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. Перечень версий служит для отображения истории публикации версий данного ресурса.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 9 Записи в English (14 KB) - Частота обновления: unknown
Метаданные в формате EML Скачать в English (9 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (9 KB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

Peeters K (2020): Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. v1.0. SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Dataset/Samplingevent. https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=heterotrophic_bacterial_isolates_in_antarctica_microbial_mats&v=1.0

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является SCAR - Microbial Antarctic Resource System. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 74277118-41a6-4e2b-bfe3-4d002cca369f.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Scientific Committee on Antarctic Research.

Ключевые слова

Samplingevent

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Anne Willems
Ghent University Ghent BE

Кем заполнены метаданные:

Maxime Sweetlove
Royal Belgian Institute of Natural Sciences Rue Vautier 29 1000 Brussels

Кто еще связан с данным ресурсом:

User
Anne Willems
Ghent University Ghent BE
Karolien Peeters
Ghent University Ghent BE

Географический охват

Different water bodies (lakes) on the Antarctic continent: East Antarctica, the Trans-Antarctic Mountains, and the Antarctic Peninsula

Ограничивающие координаты Юг Запад [-82.45, -67.45], Север Восток [-67.7, 39.8]

Таксономический охват

Heterotrophic Bacteria (504 strains) isolated from frozen microbial mat samples using culturing techniques.

Kingdom  Bacteria (Bacteria)

Данные проекта

The AMBIO project aimed to extend the baseline information of microbial diversity in aquatic habitats of terrestrial Antarctic environments.

Название Antarctic Microbial Biodiversity (AMBIO)
Финансирование BelSPO SD/BA/01
Описание района исследования the Antarctic continent.

Исполнители проекта:

Annick Wilmotte
Anne Willems
Elie Verleyen
Wim Vyverman

Методы сбора

Microbial mat samples were collected aseptically using a sterile spatula, and were kept frozen continuously after collection until processing in the laboratory.

Охват исследования Bacterial strain isolated from five aquatic microbial mat samples from different locations in continental Antarctica and the Antarctic Peninsula, sampled between 2003 and 2007.

Описание этапа методики:

  1. One gram of sample was aseptically weighed and homogenized in 9 ml sterile cold (4°C) physiological saline (0.86% NaCl) using a vortex. Tenfold dilution series (kept at 4°C) were plated on four different media (Marine agar 2216 (MA) (BD DifcoTM), R2A (BD DifcoTM), ten times diluted R2A (R2A/10), and PYGV (Pepton-Yeast-Glucose-Vitamin) medium (DSMZ medium 621)) and incubated at 20°C, 15°C and 4°C. R2A (Difco) contains pyruvate, starch and dextrose as C sources and yeast extract, peptone and casaminoacids as N and C sources and PYGV (DSMZ medium 621) contains peptone, yeast extract and glucose as C and/or N sources and additional vitamins and minerals. Both are considered oligotrophic media because the amounts of these components are at least two to ten times lower than in more general media such as nutrient broth. In addition to regular physiological saline (PS) dilution series, sea water (SW) dilutions were used for the LA3 and WO10 samples which originated from lakes close to the ocean and had elevated conductivity values.

Данные коллекции

Название коллекции BCCM-LMG
Идентификатор коллекции BCCM-LMG

Библиографические ссылки

  1. K. Peeters, E. Verleyen, D. A. Hodgson, P. Convey, D. Ertz , W. Vyverman, A. Willems (2012). Heterotrophic bacterial diversity in aquatic microbial mat communities from Antarctica. Polar Biol (2012) 35:543‐554. DOI 10.1007/s00300‐011‐1100‐4

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://ipt.biodiversity.aq/resource?r=heterotrophic_bacterial_isolates_in_antarctica_microbial_mats