Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

Última versión publicado por SCAR - Microbial Antarctic Resource System el mar 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Fecha de publicación:
28 de marzo de 2019
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Scientific Committee on Antarctic Research.

Palabras clave

Metadata

Contactos

Eric Collins
  • Originador
  • Punto De Contacto
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences
Fairbanks
US
Maxime Sweetlove
  • Proveedor De Los Metadatos
Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Rue Vautier 29
1000 Brussels
BE

Cobertura geográfica

Complete coverage of the Arctic marine environments.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [67,668, -176,761], Latitud Máxima Longitud Máxima [89,99, 157,828]

Cobertura taxonómica

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Dominio Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Dominio Bacteria (Bacteria), Archaea (Archaea)

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2007-11-20 / 2016-07-29