Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

Metadata-only
Последняя версия опубликовано SCAR - Microbial Antarctic Resource System мар. 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Дата публикации:
28 марта 2019 г.
Опубликовано:
SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию метаданных ресурса (только метаданные) в формате EML или RTF:

Метаданные в формате EML Скачать в English (6 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (6 KB)

Описание

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Scientific Committee on Antarctic Research.

Ключевые слова

Metadata

Контакты

Eric Collins
  • Originator ●
  • Point Of Contact
  • Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences
Fairbanks
US
Maxime Sweetlove
  • Metadata Provider
  • Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
  • Rue Vautier 29
1000 Brussels
BE

Географический охват

Complete coverage of the Arctic marine environments.

Ограничивающие координаты Юг Запад [67,668, -176,761], Север Восток [89,99, 157,828]

Таксономический охват

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Domain Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Domain Bacteria (Bacteria), Archaea (Archaea)

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2007-11-20 / 2016-07-29

Дополнительные метаданные