Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

Métadonnées uniquement
Dernière version Publié par SCAR - Microbial Antarctic Resource System le mars 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
Date de publication:
28 mars 2019
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

Versions

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Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est SCAR - Microbial Antarctic Resource System. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15.  SCAR - Microbial Antarctic Resource System publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Scientific Committee on Antarctic Research.

Mots-clé

Metadata

Contacts

Eric Collins
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences
Fairbanks
US
Maxime Sweetlove
  • Fournisseur Des Métadonnées
Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
Rue Vautier 29
1000 Brussels
BE

Couverture géographique

Complete coverage of the Arctic marine environments.

Enveloppe géographique Sud Ouest [67,668, -176,761], Nord Est [89,99, 157,828]

Couverture taxonomique

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Domain Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Domain Bacteria (Bacteria), Archaea (Archaea)

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2007-11-20 / 2016-07-29