Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

メタデータ
最新バージョン SCAR - Microbial Antarctic Resource System により出版 3月 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
公開日:
2019年3月28日
ライセンス:
CC-BY 4.0

メタデータのみリソース のメタデータの最新版をEML または RTF としてダウンロード：

EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (6 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (6 KB)

説明

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は SCAR - Microbial Antarctic Resource System。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15が割り当てられています。   Scientific Committee on Antarctic Research によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているSCAR - Microbial Antarctic Resource System が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Metadata

連絡先

Eric Collins
  • 最初のデータ採集者 ●
  • 連絡先
  • Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences
Fairbanks
US
Maxime Sweetlove
  • メタデータ提供者
  • Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
  • Rue Vautier 29
1000 Brussels
BE

地理的範囲

Complete coverage of the Arctic marine environments.

座標（緯度経度） 南 西 [67.668, -176.761], 北 東 [89.99, 157.828]

生物分類学的範囲

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Domain Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Domain Bacteria (Bacteria), Archaea (Archaea)

時間的範囲

開始日 / 終了日 2007-11-20 / 2016-07-29