Microbial metabarcoding surveys (Bacteria, Archaea and Eukaryota) of the arctic marine environment

元數據
最新版本 published by SCAR - Microbial Antarctic Resource System on 3月 28, 2019 SCAR - Microbial Antarctic Resource System
發布日期:
2019年3月28日
授權條款:
CC-BY 4.0

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說明

Large amplicon sequencing dataset (Illumina MiSeq) targeting Bacteria/Archaea (16S ssu rRNA gene) and Eukaryota (18S ssu rRNA gene) from samples taken in the Arctic marine environment, following the Earth Microbiome Project protocol.

版本

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權利

研究者應尊重以下權利聲明。:

此資料的發布者及權利單位為 SCAR - Microbial Antarctic Resource System。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF 註冊

此資源已向GBIF註冊，並指定以下之GBIF UUID: a5aa5dde-aba1-475e-8781-d3a451b0eb15。  SCAR - Microbial Antarctic Resource System 發佈此資源，並經由Scientific Committee on Antarctic Research同意向GBIF註冊成為資料發佈者。

關鍵字

Metadata

聯絡資訊

Eric Collins
  • 出處 ●
  • 連絡人
  • Assistant professor
College of Fisheries and Ocean Sciences
Fairbanks
US
Maxime Sweetlove
  • 元數據提供者
  • Research assistant
Royal Belgian Institute of Natural Sciences
  • Rue Vautier 29
1000 Brussels
BE

地理涵蓋範圍

Complete coverage of the Arctic marine environments.

界定座標範圍 緯度南界 經度西界 [67.668, -176.761], 緯度北界 經度東界 [89.99, 157.828]

分類群涵蓋範圍

Eukaryotes in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 18S ssu rRNA gene, using the primer set published by Stoeck et al. (doi:10.1111/j.1365-294X.2009.04480.x) TAReuk454FWD1 CCAGCASCYGCGGTAATTCC TAReukREV3_modified ACTTTCGTTCTTGATYRATGA

Domain Eukaryota (Eukaryotes)

Bacteria and Archaea in marine environments, profiled by sequencing the v4 region of the 16S ssu rRNA gene, using the primer set published by Apprill et al. (doi:10.3354/ame01753) 515F GTGCCAGCMGCCGCGGTAA 806RB GGACTACNVGGGTWTCTAAT

Domain Bacteria (Bacteria), Archaea (Archaea)

時間涵蓋範圍

起始日期 / 結束日期 2007-11-20 / 2016-07-29